不同凍干機(jī)性能差別很大，與干燥速率相關(guān)的性能主要是冷阱溫度，凍干倉(cāng)和冷阱之間的壓力差大小。

壓力差由凍干倉(cāng)中的物料和冷凝器間溫差決定，兩者間溫差越大，壓力差就越大，水蒸汽由凍干倉(cāng)向冷凝器方向流動(dòng)的速度也越快，干燥時(shí)間就越短，所以冷阱溫度高低是影響運(yùn)行成本的重要因素。但以較高能耗為代價(jià)獲得較低的冷阱溫度仍會(huì)增加運(yùn)行成本，所以能源消耗指標(biāo)也很重要。此外凍干機(jī)的真空度變化和熱傳導(dǎo)能力也對(duì)運(yùn)行成本產(chǎn)生一定影響。

控制預(yù)凍速度，也能夠影響干燥速率。預(yù)凍速度快，冰晶粒細(xì)小，已干層孔隙細(xì)密，水分子穿越已干層流動(dòng)的阻力大，影響干燥速度。適當(dāng)降低預(yù)凍速度，使冰晶粒粗大，已干層孔隙大將有利于水蒸汽流動(dòng)，提高干燥速度。

而在干燥中后期，隨著產(chǎn)品已干層厚度的增加，使冰層表面受熱愈加困難，干燥速度減緩，在真空環(huán)境里空氣稀薄，傳導(dǎo)和輻射是對(duì)產(chǎn)品冰層加熱的主要方法，提高傳熱量是加快干燥速度方法。