凍干機由制冷系統、真空系統、加熱系統、電器儀表控制系統所組成。凍干機主要部件為干燥箱、凝結器、冷凍機組、真空泵、加熱/冷卻裝置等。凍干機它的工作原理是將被干燥的物品先凍結到三相點溫度以下，然后在真空條件下使物品中的固態水份(冰)直接升華成水蒸氣，從物品中排除，使物品干燥。物料經前處理后，被送入速凍倉凍結，再送入干燥倉升華脫水，之后在后處理車間包裝。凍干機真空系統為升華干燥倉建立低氣壓條件，加熱系統向物料提供升華潛熱，制冷系統向冷阱和干燥室提供所需的冷量。凍干機采用輻射加熱，物料受熱均勻；采用捕水冷阱，并可實現快速化霜；采用真空機組，并可實現油水分離；采用并聯集中制冷系統，多路按需供冷，工況穩定，有利節能；采用人工智能控制，控制精度高，操作方便。
　　
　　次使用凍干機時，必須對儀器各部件進行*的清潔，不銹鋼的部件使用乙醇進行清洗，有機玻璃使用生理鹽水進行清洗，安瓿瓶用超聲波清洗機進行清洗。
　　
　　冷凍干燥之前必須要進行預凍，欲動需要準備低溫冰箱，零下40攝氏度，或者是零下80攝氏度的低溫冰箱，把準備干燥的物品置于低溫冰箱或液氮中，一般需要四個小時左右，可以直接從外面進行觀察到，物品*冰凍結實后，才可進行冷凍干燥的實驗，把物品迅速移動到真空冷凍干燥機托盤之內，以保證冷凍干燥效果。
　　
　　凍干機八大運用：
　　
　　1、生物制品制劑方面：如抗菌素、抗毒素、確診用品和疫苗的保存。
　　
　　2、微生物和藻類方面：如各種細菌、酵母、酵素、原生動物、微細藻類等的長時間保存。
　　
　　3、生物標本、生物組織方面：如制作各種動植物標本，單調保存用于動物異種或同種移植的皮膚、骨骼、主動脈、心瓣膜等邊際組織。
　　
　　4、制作用于光學顯微鏡、電子掃描和透射顯微鏡的小組織片。
　　
　　5、食物的單調方面：如咖啡、茶葉、肉魚蛋類、海藻、生果、蔬菜、調料、豆腐、便利食物等。
　　
　　6、營養品及中草藥方面：如蜂王漿、蜂蜜、花粉、中草藥制劑等。
　　
　　7、超纖細粉的制備方面：如制取Al2O3、ZrO2、TiO2、Ba2Cu3O7～8、Ba2Ti9O20等超纖細粉。
　　
　　8、其他方面：如化工中的催化劑，凍干后可跋涉催化功率5～20倍；將植物葉子、土壤凍干保存，用以研討土壤、肥料、氣候對植物生長的影響及因子的作用；濕潤的木制文物、淹壞的書本稿件等用凍干法單調。